Dolina Biebrzy należy do najważniejszych krajowych ostoi migrujących ptaków wodnych. Poza wybrzeżem Bałtyku, jedynie ujście Warty może równać się z Biebrzą pod względem liczebności tej grupy ptaków. Na biebrzańskich rozlewiskach obserwuje się rekordowe koncentracje kilku gatunków kaczek, gęsi i ptaków siewkowych przelatujących przez Polskę.